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실험실/실험(Experiments)

Transformation 의 효율을 계산 해보자.

by 준준xy 2020. 2. 9.

Transformation efficiency는 어떻게 계산하는 건가?

내가 만든 competent cell이 효율이 얼마 정도 될까?

아니면 A 컴셀과 B 컴셀의 TF 효율은 얼마나 차이날까?

이럴때 TF 효율을 계산하면 된다.

보통의 경우 많이 사용하는 puc18과 같은 vector를 가지고 기준을 잡아도 되고

아니면 실험실에 넘쳐나는 vector를 가지고 계산을 해도 무방하다.

하지만 A 컴셀에는 C vector B 컴셀에는 D vector를 TF하면 안되겠죠?

vector의 크기에 따라서 TF 효율의 차이가 있으니까.

 

TF할 때 heat shock을 하면,

컴셀 50ul에 vector 1ul

on ice 30m

42℃ 1m 30s

on ice 2m

SOC 800ul 넣고

1h 30m 37℃ 쉐이킹

20ul 스프레딩

그리고 나온 colony 카운트

 

ex)

vector concentration 1000 ug/ml = 0.001 ug/ul;

vector 1ul 넣어주었고,

total reaction volume 은 50ul + 1ul + 800ul

20ul spreading.

colony 계수 - 250개.

효율 = 1.06375e7

참 좋은 세상인게 위의 정보만 있으면 계산을 해줌

그림을 눌러보자.