전체 글182 23.09.01 Kristine Bonnevie lecture 참석 후기, Kristine Bonnevie는 노르웨이에서 처음으로 박사 학위를 받은 여성 과학자이자, 최초의 여성 교수, 그리고 여성 권리 활동가이자 정치가로, 모교인 Oslo 대학은 그녀의 훌륭한 업적을 기리기 위해 매년 유명한 연사를 초청하여 강의를 진행하고 있다. 장소는 오슬로 시내에서 유명한 Karl Johans street에 위치한 오슬로 대학의 Domus Academica 건물이었는데, 멋진 외관과 내부는 행사의 격을 더 높여 주는 것 같았다. 올해의 연사는 2020년 노벨화학상을 수상한 두 명의 과학자 중 Streptococus pyogenes가 바이러스 감염에 대한 방어 기작으로 바이러스 DNA를 분해하는 CRISPR/Cas9의 존재를 201.. 2023. 9. 2. 23.08.23 이번 학기에도 석사 학생을 대상으로 수업을 하여야 해서 미팅에 참석하였다. 노르웨이의 강의는 한국과 다르게, 한 과목에 여러 사람이 기여를 하는데 (이번 class에는 2명이 주로 수업을 이끌어 가고, 포닥 4명과 박사 과정 3명이 서포트 하는 방식이다.) 수업은 크게 5개의 모듈로 구성되어 있고, module0는 introduction 과 overview, 1,2,3는 차례로 서로 다른 species사이, 같은 species 그리고 조직과 cell level에서 유전체 분석과 관련된 기술과 insight를 제공하는 것을 목표로 한다. 마지막으로 module4는 수업 주제를 바탕으로 themes와 questions들을 제공하고 그것과 관련된 그룹 발표를 진행 하는 것이다. 이번 학기에 56명이 수강을 하.. 2023. 8. 24. Higlass Hi-C data를 처음 다룰 때 보면 너무나도 다양한 tool들이 있어 머리가 좀 복잡해지지만, 읽다 보면 Jucier를 이용하거나 또는 Hic-pro를 이용하는 크게 두 가지 갈래로 나누어지는 것 같다. 둘 다 reference genome의 여러 bin으로 표시한 다음, Bowtie2를 이용하여 PE(pari-end) read를 붙이고, 그 bin 내부 또는 bin과 bin 사이의 interaction을 counting 하고 visualization 하는 형식이다. 따라서 설정하는 bowtie2의 parameter에 따라 binding 정도가 달라지며 그 결과는 QC results에서 확인할 수 있다. Pipeline analysis가 끝났을 때 Jucier의 경우 contact map output.. 2023. 8. 18. 23.08.13 여름휴가의 마무리와 재충전, 노르웨이로 어머니가 오셔서 약 일주일간 시간을 같이 보내기 위해 조금 늦게 휴가를 신청하였다. 일단 나의 경우 일 년에 25일의 휴가 기간이 주어지고, 작년 계약 시기가 조금 늦었던 나의 경우에 올해 19일의 유급 휴가가 주어졌다. 그중, 올 겨울 친구들이 왔을 때와 lofoten으로 여행을 간다고 써서 남았던 15일의 절반 가량을 사용하였고, 그 결과 이곳에 온 이후로 가장 오랜 시간 학교로 출근하지 않았다. 운전을 할 줄 모르는 내가 오슬로에 지인이 오면 하는 것은 오슬로 패스를 사는 것이다… 이번이 벌써 세 번째 오슬로 패스를 구입하는 것이고, 같은 박물관을 세 번이나 가면서도 매번 재미있는 것은 아마 각기 다른 향을 가진 사람들 덕분이라는 생각이 든다. 그리고 겨울에 .. 2023. 8. 14. 이전 1 2 3 4 5 6 7 8 ··· 46 다음
